中药制剂室于1995年成立，为福建省中医重点专科建设项目，是集生产、科研、教学为一体、具有中医药传统特色的重点科室之一。专科占地约2600m2，已投资1500多万元，现为省内目前规模居前、设施先进的现代化制剂室。专科目前拥有生产工艺成熟、质量稳定、疗效确切、安全性好的38个中药制剂，芪灵扶正清解颗粒、麻荆止咳颗粒、生化合剂II号、清化饮、舒筋止痛水、健心颗粒、乳消III号胶囊等品种深受患者欢迎，为发挥我院中医药传承和中医诊疗特色、扩大中医药影响建立良好的基础。专科承担国家、部、省等各级科研课题20多项，在医院中药制剂研发方面，取得了优异的成绩，近年来完成国医大师杨春波和全国家名中医（杜建等）的临床验方以及各级重点专科制剂（14个品种）的发掘整理。